骨頭是一種活的組織，新陳代謝有賴於骨中的造骨及蝕骨細胞，其中造骨細胞製造新的骨頭，而蝕骨細胞在破壞及吸收舊的骨頭，有證據顯示，類固醇的作用會抑制造骨細胞的活性及促進蝕骨細胞的活性，相對的結果就會造成骨質的流失。 

骨質疏鬆症是使用類固醇患者常見的後遺症。若說停經後的婦女，骨質密度降低一個標準差，骨折的危險性增加為2倍；長期使用類固醇的人，同樣程度骨密度的減低卻可能造成骨折危險性增加2到6倍。且類固醇造成的骨質流失在使用的第一年內最快，之後骨質的流失也比正常人來得高，甚至在非常低類固醇劑量下，也有可能發生骨質流失。